在第五季的结尾，杰克（基弗·萨瑟兰 Kiefer Sutherland 饰）意外的被中国秘密逮捕，在长达20个月的关押期。杰克忍受着非人的严刑拷问却没有说一句话。而此时的美国，却遭受到恐怖分子炸弹袭击的威胁，而且证据显示可能是伊斯兰教派武装组织所为。CTU方面调查发现，这一系列恐怖袭击的背后主使是一个名叫阿萨德的伊斯兰恐怖分子。而为了能顺利实施针对阿萨德的刺杀计划，美国和中方交涉，换回了被关押的杰克•鲍尔。打算利用杰克作为诱饵，引出阿萨德。可是，在引诱阿萨德出现的一系列活动中，杰克却发现这次恐怖袭击的幕后主使另有其人。为了化解即将到来的恐怖袭击，杰克再次挺身而出，只身与恐怖分子展开了较量……

　　这一季的故事出现,产生,形成,酿成在上一季的3年后。这一季里，托尼（卡洛斯·博纳德 Carlos Bernard 饰）和米歇尔（蕾可·艾尔丝沃斯 Reiko Aylesworth 饰）成婚,完婚,婚配,嫁娶了，并且成为了CTU的主管，而杰克（基弗·萨瑟兰 Kiefer Sutherland 饰）的孩子,女孩,少女,千金金姆也加入CTU成为了一 名情报分析员。剧情由一具被扔在洛杉矶卫生中心外并感染了致命病毒的尸体起始,开端,肇始,启始。一个墨西哥毒枭为了让美国政府释放自己的哥哥，以致命病毒为恐吓。杰克也因此又踏上了反恐调查之路。而这一季里面，杰克的调查并不顺利，为了打入毒贩内部，杰克不惜染上毒瘾，这导致他在调查中困难重重。而白宫方面，获得连任的鲍尔默总统（丹尼斯·海斯伯特 Dennis Haysbert 饰）康复后身边多出了一位私人医生女友，而总统的弟弟韦恩成为了他的得力助手，在连任压力面前，又要化解这场生化危机。总统还能像前几次那样给予杰克强有力的支援,扶持,拥护,维护吗？

　　在这一季里面，杰克·鲍尔（基弗·萨瑟兰 Kiefer Sutherland 饰）戒掉了在第三季中染上的毒瘾，并且离去,分离,离别,离别,分别,分离,别离,分散,远离,分离了CTU而起始,开端,肇始,启始为国防部长职业,事业,工作岗位,职责。但是杰克始终摆脱不了与CTU的联系，剧集一起始,开端,肇始,启始一场恐怖袭击致使的列车出轨事故使CTU不得不召回杰克进行此事的调查。才深入调查此事没多久，杰克就发现恐怖分子的下一个目标就是国防部长。经过杰克的奋斗,拼搏,奋进,进取，好不容易解救了被绑架的国防部长，化解了这次危机。原本以为可以松一口气的杰克，却发现刺杀国防部长只是恐怖分子设置的一个扰乱CTU调查的小环节。恐怖分子的真正目的是控制全美国的核电站，通过让核电站超负荷运转引起核泄漏进而威胁全美国，危机这才真正上演……